数据描述
引言与背景
COVID-19疫情的全球爆发促使学术界和医疗界对冠状病毒相关研究进行了前所未有的关注。为支持相关研究和算法开发,COVID-19文学分析数据集(CovLAD)应运而生。该数据集涵盖了26044篇与冠状病毒相关的学术文献,包含完整的文章文本、元数据和多维度标注信息,为医学研究、自然语言处理算法训练以及公共卫生政策制定提供了宝贵资源。
数据基本信息
数据字段说明
| 字段名称 | 字段类型 | 字段含义 | 数据示例 | 完整性 |
|---|---|---|---|---|
| paper_id | 字符串 | 文献唯一标识符 | 252878458973ebf8c4a149447b2887f0e553e7b5 | 100% |
| abstract | 字符串 | 文献摘要 | Background: The 3C-like protease... | 73.78%(缺失26.22%) |
| body_text | 字符串 | 文献正文内容 | In a global world knowledge of imported infecti... | 100% |
| authors | 字符串 | 文献作者 | Domingo, Esteban | 100% |
| title | 字符串 | 文献标题 | The Molecular Biology of Coronaviruses | 100% |
| journal | 字符串 | 发表期刊 | PLoS One | 100% |
| abstract_summary | 字符串 | 摘要总结 | Not provided. | 100% |
| Labels | 整数 | 文献分类标签 | 4 | 100% |
| Unnamed: 0.1 | 整数 | 索引字段 | 13021 | 100% |
| Unnamed: 0 | 整数 | 原始索引字段 | 14172 | 100% |
数据分布情况
期刊分布(前20名)
| 期刊名称 | 记录数量 | 占比(%) |
|---|---|---|
| PLoS One | 1511 | 5.80 |
| Virology | 699 | 2.68 |
| Emerg Infect Dis | 635 | 2.44 |
| Viruses | 538 | 2.07 |
| Sci Rep | 432 | 1.66 |
| Veterinary Microbiology | 414 | 1.59 |
| Virus Research | 411 | 1.58 |
| Virol J | 353 | 1.36 |
| Journal of Virological Methods | 352 | 1.35 |
| PLoS Pathog | 340 | 1.31 |
| Vaccine | 326 | 1.25 |
| The Lancet | 295 | 1.13 |
| Antiviral Research | 288 | 1.11 |
| Journal of Clinical Virology | 242 | 0.93 |
| BMC Infect Dis | 237 | 0.91 |
| American Journal of Infection Control | 208 | 0.80 |
| Front Immunol | 207 | 0.79 |
| Front Microbiol | 201 | 0.77 |
| Veterinary Immunology and Immunopathology | 164 | 0.63 |
| Nucleic Acids Res | 163 | 0.63 |
作者分布(前20名)
| 作者名称 | 发表数量 | 占比(%) |
|---|---|---|
| Domingo, Esteban | 14 | 0.05 |
| Tulchinsky, Theodore H.. Varavikova, Elena A. | 11 | 0.04 |
| Sykes, Jane E. | 10 | 0.04 |
| Wiwanitkit, Viroj | 9 | 0.03 |
| McFee, Robin B. | 9 | 0.03 |
| Decaro, Nicola. Mari, Viviana... | 8 | 0.03 |
| Potter, Polyxeni | 7 | 0.03 |
| Ryan, Jeffrey R. | 7 | 0.03 |
| Burrell, Christopher J.. Howard, Colin R.... | 7 | 0.03 |
| Greaves, Peter | 6 | 0.02 |
| Cunha, Burke A. | 6 | 0.02 |
| Woo, Patrick C.Y.. Lau, Susanna K.P.... | 6 | 0.02 |
| Decaro, Nicola. Martella, Vito... | 6 | 0.02 |
| Ford, Richard B.. Mazzaferro, Elisa M. | 6 | 0.02 |
| Louten, Jennifer | 6 | 0.02 |
| STRAUSS, JAMES H.. STRAUSS, ELLEN G. | 6 | 0.02 |
| Mizutani, Tetsuya. Fukushi, Shuetsu... | 6 | 0.02 |
| Chen, Ming-Hsiang | 6 | 0.02 |
| Cann, Alan J. | 6 | 0.02 |
| Nishiura, Hiroshi | 6 | 0.02 |
分类标签分布
| 统计指标 | 数值 |
|---|---|
| 平均值 | 7.86 |
| 标准差 | 4.49 |
| 最小值 | 0 |
| 25%分位数 | 5 |
| 中位数 | 6 |
| 75%分位数 | 12 |
| 最大值 | 16 |
数据优势
| 优势特征 | 具体表现 | 应用价值 |
|---|---|---|
| 数据规模庞大 | 包含26044篇学术文献,涵盖冠状病毒研究的多个方面 | 支持大规模系统性分析和深度学习模型训练 |
| 内容完整性高 | 提供完整的正文文本(body_text)和大部分摘要(abstract) | 允许进行深入的文本挖掘和信息提取研究 |
| 多维度标注 | 包含分类标签(Labels)和摘要总结(abstract_summary) | 便于开发和评估文本分类、摘要生成等算法 |
| 来源权威性强 | 文献来自PLoS One、Virology等知名学术期刊 | 确保数据质量和研究可靠性 |
| 结构规范化 | 数据字段统一,便于批量处理和分析 | 降低数据预处理成本,提高研究效率 |
数据样例
元数据与内容样例
以下是从数据集中随机选取的10条样例记录:
-
样例1
-
标题:Commentary: The role of viral load in COVID-19 transmission and severity
-
作者:WHO COVID-19 Research Team
-
期刊:The Lancet
-
摘要:Not provided.
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标签:12
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-
样例2
-
标题:Viral gastroenteritis: epidemiology, diagnosis and treatment
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作者:Domingo, Esteban
-
期刊:Virology
-
摘要:Viral gastroenteritis is a common cause of morbidity and mortality worldwide...
-
标签:5
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样例3
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标题:Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS): a review
-
作者:Woo, Patrick C.Y.. Lau, Susanna K.P.
-
期刊:Emerg Infect Dis
-
摘要:Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) emerged in 2003 as a novel respiratory disease...
-
标签:8
-
-
样例4
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标题:The Molecular Biology of Coronaviruses
-
作者:STRAUSS, JAMES H.. STRAUSS, ELLEN G.
-
期刊:Virology
-
摘要:Coronaviruses are a family of enveloped, positive-strand RNA viruses...
-
标签:4
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样例5
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标题:Middle East respiratory syndrome (MERS): update on epidemiology and pathogenesis
-
作者:Cunha, Burke A.
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期刊:Journal of Clinical Virology
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摘要:Middle East respiratory syndrome (MERS) is a viral respiratory disease caused by MERS-CoV...
-
标签:7
-
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样例6
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标题:Viral mechanisms of immune evasion
-
作者:Ryan, Jeffrey R.
-
期刊:Viruses
-
摘要:Viruses have evolved numerous strategies to evade the host immune response...
-
标签:6
-
-
样例7
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标题:Pneumonia: viral causes and treatment
-
作者:McFee, Robin B.
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期刊:American Journal of Infection Control
-
摘要:Viral pneumonia is a leading cause of respiratory illness worldwide...
-
标签:9
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-
样例8
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标题:Zoonoses: emerging infectious diseases from animal sources
-
作者:Nishiura, Hiroshi
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期刊:Sci Rep
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摘要:Zoonoses are infectious diseases that can be transmitted between animals and humans...
-
标签:11
-
-
样例9
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标题:Surveillance of Disease: Overview
-
作者:Tulchinsky, Theodore H.. Varavikova, Elena A.
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期刊:PLoS One
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摘要:Disease surveillance is essential for early detection and response to public health threats...
-
标签:14
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-
样例10
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标题:Response to emerging infectious diseases: lessons from SARS and MERS
-
作者:Chen, Ming-Hsiang
-
期刊:BMC Infect Dis
-
摘要:The outbreaks of SARS and MERS have highlighted the need for effective response strategies...
-
标签:13
-
应用场景
医学文献文本挖掘与知识发现
CovLAD数据集为医学文献的文本挖掘研究提供了丰富的资源。研究人员可以利用自然语言处理技术从大量文献中提取关键信息,如病毒传播机制、临床症状、治疗方法和预防策略等。例如,通过分析文献中的关键词共现网络,可以发现COVID-19研究的热点领域和发展趋势;通过提取药物名称和治疗效果描述,可以识别潜在的治疗方案。这些知识发现不仅有助于加深对冠状病毒的理解,还能为新药研发和临床实践提供指导。
自然语言处理算法训练与评估
该数据集包含完整的文本内容和多维度标注,非常适合用于训练和评估各种自然语言处理算法。例如,可以利用body_text和abstract字段训练文本分类模型,将文献归类到不同的研究领域;利用abstract和abstract_summary字段训练摘要生成模型,自动生成文献摘要;利用authors和journal字段训练实体识别模型,提取作者和期刊信息。此外,数据集的规模和多样性使得训练出的模型具有更好的泛化能力,能够应用于实际的医学文本处理任务。
公共卫生政策制定与决策支持
CovLAD数据集涵盖了冠状病毒研究的多个方面,包括流行病学、临床特征、治疗方法和公共卫生干预措施等。政策制定者可以利用这些信息了解疫情的发展趋势和影响因素,评估不同干预措施的效果,并制定相应的公共卫生政策。例如,通过分析文献中关于社交距离、戴口罩等措施的研究结果,可以为疫情防控政策提供科学依据;通过研究病毒变异和疫苗效果的文献,可以为疫苗接种策略的调整提供支持。
医学教育与知识普及
该数据集可以作为医学教育的重要资源,帮助医学生和医护人员了解冠状病毒相关的最新研究进展。通过对文献的系统分析,可以整理出冠状病毒的基本知识、诊断方法和治疗原则,制作成教学材料和科普文章。此外,数据集还可以用于开发交互式学习工具,如问答系统和知识图谱,提高医学教育的效果和趣味性。
结尾
COVID-19文学分析数据集(CovLAD)是一个规模庞大、内容丰富、结构规范的学术文献数据集,为冠状病毒相关研究提供了宝贵的资源。该数据集包含26044篇学术文献的完整正文文本、元数据和多维度标注,具有数据规模庞大、内容完整性高、来源权威性强等优势。
CovLAD数据集在医学文献文本挖掘、自然语言处理算法训练、公共卫生政策制定以及医学教育等领域具有广泛的应用价值。它不仅有助于加深对冠状病毒的理解,还能推动相关算法和技术的发展,为疫情防控和公共卫生事业做出贡献。
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验证报告
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