引言与背景
心脏疾病是全球范围内导致死亡的主要原因之一,早期准确的诊断和评估对于提高患者生存率至关重要。心脏磁共振成像(MRI)作为一种无创、高分辨率的成像技术,在心脏结构和功能评估中发挥着越来越重要的作用。为了推动心脏MRI图像分析算法的发展和临床应用,研究人员需要大规模、高质量、标注完整的数据集作为支撑。
ACDC心脏MRI影像数据集正是在这一背景下产生的,它包含了2212个高质量的心脏MRI影像文件,涵盖150位患者的心脏磁共振成像数据。该数据集不仅提供了原始的MRI图像数据,还包含了精细的分割标签和标注信息,为心脏疾病的自动诊断、分割和功能评估提供了宝贵的资源。数据集采用HDF5格式存储,便于高效读取和处理,适用于各种机器学习和深度学习算法的训练与测试。
数据基本信息
数据字段说明
| 字段类型 | 字段含义 | 数据示例 | 完整性 | |
|---|---|---|---|---|
| image | float32 | 心脏MRI原始图像数据 | 216×256像素矩阵 | 100% |
| label | uint8 | 心脏结构分割标签 | 216×256像素矩阵,值为0-3 | 100% |
| scribble | uint16 | 医生手动标注的心脏结构边界 | 216×256像素矩阵,值为0-4 |
数据分布情况
患者与帧数分布
| 数量 | 占比 | |
|---|---|---|
| 患者总数 | 150 | 100% |
| 每个患者平均帧数 | 2 | - |
| 总帧数 | 300 |
帧号分布
| 出现次数 | 占比 | |
|---|---|---|
| 1 | 149 | 49.67% |
| 12 | 26 | 8.67% |
| 9 | 24 | 8.00% |
| 10 | 24 | 8.00% |
| 11 | 24 | 8.00% |
| 13 | 15 | 5.00% |
| 7 | 10 | 3.33% |
| 8 | 9 | 3.00% |
| 14 | 7 | 2.33% |
| 6 | 3 | 1.00% |
| 15 | 4 | 1.33% |
| 16 | 4 | 1.33% |
| 4 | 1 |
图像数据统计
| 平均值 | |
|---|---|
| 最小值 | 0.01 |
| 最大值 | 1.00 |
| 平均值 | 0.22 |
| 标准差 |
数据优势
| 具体表现 | 应用价值 | |
|---|---|---|
| 数据规模大 | 包含2212个高质量心脏MRI文件,覆盖150位患者 | 提供足够的训练数据,提高模型的泛化能力 |
| 标注完整 | 每个图像都包含精细的分割标签(label)和医生手动标注(scribble) | 支持监督学习算法的训练,提高分割和诊断的准确性 |
| 格式统一 | 所有文件采用HDF5格式存储,包含统一的image、label和scribble字段 | 便于数据预处理和模型训练,降低开发成本 |
| 分辨率高 | 图像分辨率为216×256像素,提供清晰的心脏结构细节 | 支持精确的心脏结构分割和功能评估 |
| 数据多样性 | 涵盖不同帧号的心脏图像,反映心脏不同阶段的运动状态 |
数据样例
元数据样例
| 患者ID | 帧号 | 文件格式 | 图像尺寸 | |
|---|---|---|---|---|
| patient001_frame01.h5 | patient001 | 1 | HDF5 | 216×256 |
| patient001_frame12.h5 | patient001 | 12 | HDF5 | 216×256 |
| patient002_frame01.h5 | patient002 | 1 | HDF5 | 216×256 |
| patient002_frame12.h5 | patient002 | 12 | HDF5 | 216×256 |
| patient003_frame01.h5 | patient003 | 1 | HDF5 | 216×256 |
| patient003_frame15.h5 | patient003 | 15 | HDF5 | 216×256 |
| patient004_frame01.h5 | patient004 | 1 | HDF5 | 216×256 |
| patient004_frame15.h5 | patient004 | 15 | HDF5 | 216×256 |
| patient005_frame01.h5 | patient005 | 1 | HDF5 | 216×256 |
| patient005_frame13.h5 | patient005 | 13 | HDF5 |
图像与标签样例说明
每个HDF5文件包含三个主要数据集:
-
image:心脏MRI原始图像,float32类型,值范围为0-1
-
label:心脏结构分割标签,uint8类型,值为0(背景)、1(左心室腔)、2(心肌)、3(右心室腔)
-
scribble:医生手动标注的边界,uint16类型,提供更详细的结构信息
应用场景
心脏结构自动分割算法研究
ACDC数据集提供了大量带有精细标注的心脏MRI图像,是开发和评估心脏结构自动分割算法的理想资源。研究人员可以利用该数据集训练深度学习模型,实现左心室腔、心肌和右心室腔的自动分割。自动分割算法可以大大提高临床工作效率,减少医生的手动标注工作量,同时提高分割的一致性和准确性。基于完整的原始图像数据,模型可以学习到丰富的图像特征,实现更精确的分割结果,为心脏疾病的诊断和治疗提供可靠的依据。
心脏功能评估与定量分析
该数据集包含不同帧号的心脏图像,可以反映心脏在不同收缩和舒张阶段的状态。研究人员可以利用这些数据开发心脏功能评估算法,计算射血分数、心室容积等重要的功能指标。这些指标对于评估心脏健康状况、监测疾病进展和评估治疗效果至关重要。通过自动分析大量的心脏MRI数据,可以发现传统方法难以察觉的微妙变化,提高心脏疾病的早期诊断率。
心脏疾病诊断与分类
ACDC数据集可以用于开发心脏疾病的自动诊断和分类算法。通过分析心脏图像的结构和功能特征,模型可以识别出不同类型的心脏疾病,如心肌病、心力衰竭等。自动诊断系统可以作为医生的辅助工具,提供客观的诊断建议,提高诊断的准确性和效率。此外,数据集的多样性也使得模型能够处理不同类型的心脏疾病,提高其在临床应用中的适用性。
医学影像分析算法的性能评估
ACDC数据集是评估医学影像分析算法性能的标准化 benchmark。研究人员可以使用该数据集测试不同算法的分割精度、计算效率和鲁棒性,进行公平的比较和评估。这有助于推动医学影像分析领域的技术进步,促进更好的算法的开发和应用。同时,标准化的评估也有助于算法的临床转化,提高其在实际应用中的可靠性。
医学教育与培训
该数据集还可以用于医学教育和培训,帮助医学生和年轻医生学习心脏MRI图像的解读和分析。通过对比自动分割结果和手动标注,学习者可以更好地理解心脏的解剖结构和MRI图像特征。此外,数据集的多样性也可以帮助学习者熟悉不同类型的心脏图像和可能存在的异常情况,提高其诊断能力。
结尾
ACDC心脏MRI影像数据集是一个大规模、高质量的心脏磁共振成像数据集,包含2212个HDF5格式的文件,涵盖150位患者的心脏图像数据。该数据集不仅提供了原始的MRI图像,还包含了精细的分割标签和医生手动标注的边界信息,为心脏疾病的自动诊断、分割和功能评估提供了宝贵的资源。
该数据集具有数据规模大、标注完整、格式统一、分辨率高和数据多样性等优势,适用于多种应用场景,包括心脏结构自动分割、心脏功能评估、心脏疾病诊断与分类、医学影像分析算法的性能评估以及医学教育与培训。基于完整的原始图像数据,研究人员可以开发出更精确、更可靠的心脏MRI分析算法,推动心脏疾病诊断和治疗的进步。
ACDC数据集的应用前景广阔,有望在医学影像分析、人工智能辅助诊断和临床决策支持等领域发挥重要作用。随着深度学习和计算机视觉技术的不断发展,该数据集将为心脏疾病的早期诊断和治疗提供更加强有力的支持,最终改善患者的预后和生活质量。
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